Das Spiel folgt Guybrush Threepwood und Elaine Marley, nachdem sie von ihren Flitterwochen auf die Insel Mêlée zurückkehren. Dort stellen sie fest, dass Elaine Marleys Position als Gouverneurin aufgehoben wurde, ihre Villa demoliert werden soll und ein Politiker namens Charles L. Charles für das Gouverneursamt kandidiert. Guybrush erfährt, dass die Inseln einzeln gekauft werden und die Piraten zugunsten eines karibischen Tourismus vertrieben werden. Guybrush muss herausfinden, wer seine Lebensweise und die Piraterie bedroht, und einen Weg finden, Elaines Haus zu retten.
The game follows Guybrush Threepwood and Elaine Marley as they return to Mêlée Island from their honeymoon. There they discover that Elaine Marley's position of governor has been revoked, her mansion is scheduled to be demolished, and a politician named Charles L. Charles is running for the governorship. Guybrush learns that the islands are being purchased one by one, and pirates are being forced out in favor of tacky Carribean-themed tourism. Guybrush must find out who is threatening his way of life, piracy, and also find a way to save Elaine's mansion.
El juego sigue a Guybrush Threepwood y Elaine Marley cuando regresan a Mêlée Island desde su luna de miel. Allí descubren que la posición de gobernador de Elaine Marley ha sido revocada, su mansión está programada para ser demolida, y un político llamado Charles L. Charles se postula para la gobernación. Guybrush se entera de que las islas se están comprando una a una, y los piratas se ven obligados a abandonar el tórrido turismo caribeño. Guybrush debe descubrir quién está amenazando su forma de vida, la piratería y también encontrar una manera de salvar la mansión de Elaine.
Guybrush Threepwood et Elaine Marley sont de retour de lune de miel. Malheureusement, leur retour sur Mêlée Island est beaucoup plus problématique que prévu. Elaine est déclarée morte, la propriété est sur le point d'être détruite et un inconnu se propose au poste de gouverneur. Pendant ce temps-là, un entrepreneur australien du nom d'Ozzie Mandrill achète des îles dans les environs pour en faire un complexe touristique et, accessoirement, en déloger les pirates.
C'est à Guybrush de régler ces quelques déboires administratifs, ce qui l'emmènera de nouveau vers la terrible île aux singes.
Il gioco segue Guybrush Threepwood ed Elaine Marley mentre tornano a Mêlée Island dalla luna di miele. Lì scoprono che la posizione di governatore di Elaine Marley è stata revocata, la sua villa è programmata per essere demolita e un politico di nome Charles L. Charles è in corsa per il governatorato. Guybrush viene a sapere che le isole vengono acquistate una per una e che i pirati vengono costretti a fuggire a favore del pacchiano turismo a tema caraibico. Guybrush deve scoprire chi sta minacciando il suo stile di vita, la pirateria, e trovare anche un modo per salvare la villa di Elaine.